Abstract:

Mit diesem Vortrag stellen wir neuartige Ansätze zu Verarbeitung von Daten im Bereich BioInformatics/Life Science vor, die am Lehrstuhl in den vergangenen Jahren in Kooperation mit Biologen und der Industrie entstanden sind. Dabei gehen wir auf die Herausforderung bei der Verarbeitung genomischer Daten an drei Beispielen ein, bei denen die Realisierung besonders auf skalierbarer Datenbanktechnologie basiert.
Darüberhinaus werden bei den Lösungen andere Technologien mitein bezogen (z.B. Workflow-Technologie), die ebenfalls eine sehr wichtige Rolle bei der Entwicklung praktischer Lösungen sind.

Gleichzeitig beschreiben wir, welche grundlegenden Probleme bei der Speicherung und bei der Bearbeitung genomischer Daten bestehen, die nur dann erfolgreich gelöst werden können, wenn semantische Eigenschaften der Daten und Prozesse verstanden und bei einer Lösung miteinbezogen werden. Abschliessend gehen wir auf ein fertiges Werkzeug ein, den Gene-Viator, mit dessen Hilfe komplexe Zusammenhänge effizient und zielgerichtet visualisiert werden können.

Die vorgestellten Arbeiten werden durch das BMBF und die Firma IBM unterstützt.