Christen, V.

REx – eine Webapplikation zur Visualisierung der Evolution von Ontologien in den Lebenswissenschaften

Studentenkonferenz Informatik Leipzig (SKIL) 2012

2012 / 09

Paper

Futher information: http://dbs.uni-leipzig.de/rex

Abstract

Ontologien sind im Bereich der Lebenswissenschaften für die maschinelle Analyse und Auswertung von Daten unerlässlich. Mithilfe von Ontologien lassen sich molekular-biologische Objekte wie Proteine oder Gene konsistent und einheitlich beschreiben (annotieren), so dass ein maschineninterpretierbarer und semantischer Rahmen für ein Themengebiet spezifiziert werden kann. Durch neue Anforderungen sowie geändertes Domänenwissen unterliegen sie einem ständigen Veränderungsprozess (Evolution). Die Webanwendung REx (Region Evolution Explorer) ermöglicht die Visualisierung von Veränderungen innerhalb einer Ontologie. Dabei werden für veröffentlichte Versionen innerhalb eines Zeitraums Regionen mit hoher (geringer) Änderungsintensität ermittelt. Nutzer können sich diese Regionen über verschiedene Workflows visualisieren lassen, um somit die Evolution insbesondere von großen Ontologien kompakter und besser zu verstehen. REx wurde anhand zahlreicher, großer Ontologien in den Lebenswissenschaften evaluiert und ist unter <a href="http://dbs.uni-leipzig.de/rex">http://dbs.uni-leipzig.de/rex</a&gt; verfügbar.