Wintersemester 2014/15
  • Donnerstag 09:15-10:45, HS 19
Thursday, 16.10.2014

Anmeldung

Die Anmeldung zur Vorlesung, Übung und Klausur erfolgt über AlmaWeb.

  • Achtung: Sie müssen sich für das Modul und die Veranstaltungen (Vorlesung + Übung) anmelden.
  • Bei Fragen und Problemen zur Anmeldung wenden Sie sich bitte immer an das Studienbüro via einschreibung [at] math.uni-leipzig.de (einschreibung(at)math.uni-leipzig.de)

Teilnehmerkreis

  • Studenten der Informatik
  • Studenten anderer Fachrichtungen

Übersicht

Die Vorlesung “Bio Data Management” (BioDM) behandelt Datenbanken im Bereich der Bioinformatik sowie typische Verfahren und Algorithmen zur Datenverwaltung, Datenanalyse, etc.. 
Die notwendigen Kenntnisse aus dem Bereich Biologie werden in den Grundlagen vermittelt, d.h. es sind keine speziellen Vorkenntnisse aus den Bio-Wissenschaften erforderlich.

Übung

Zur Anwendung des Vorlesungsstoffes werden Online-Übungen im E-Learning-System LOTS in der Gruppe “BioDM_WS2014” angeboten. Um der Gruppe in LOTS beizutreten geben Sie als Kennung biodm#ws14 ein (siehe auch LOTS-Hinweise).

Gliederung

KapitelThema
0Organisation/Inhalt
1Motivation und Grundlagen
2Bio-Datenbanken
3Datenmodelle und Anfragesprachen (update 2.11.)
4Modellierung von Bio-Datenbanken (update 20.11.)
5(a) Sequenzierung und Alignments , (b) NGS Data Management
6Genexpressionsanalyse
7Annotationen
8Datenintegration
9Ontologiematching + Zusatz UMLS
10Versionierung von Datenbeständen